時は太正… 帝都・東京は、蒸気機関の飛躍的な進歩と、日本古来からの文化、 そして押し寄せる西洋化の波とが入り交じった幻惑の都市として 東洋一の繁栄を誇っていた。 だが、その華やかな時代の裏舞台に 暗躍する邪なる闇の者、魑魅魍魎…… それら悪の軍勢から、帝都の平和を守るべく結成された秘密部隊 「帝国華撃団」。 その主戦力部隊『花組』には、類いまれなる 霊力を持つ６人のうら若き乙女たちがいた。 平時は、銀座・大帝国劇場で「帝国歌劇団」の花形スターとして 舞台の上に青春をかけ、帝都に悪なす者が現れれば、 霊子甲冑・光武に乗り込み、帝都の平和のため命をかける。 そんな花組の隊長として任命されたのは海軍少尉・大神一郎。 実験的な戦闘部隊「星組」の元隊員２人も花組に配属され、 的確な指揮と８人の乙女たちとの強い信頼関係を武器に、 数々の戦闘に勝利していく。 太正15年、春。 帝都防衛の実績を認められた大神は、フランス留学を命じられる。 花組の隊員たちと別れ、帝都をはるか離れた異郷の地フランスで 大神を待ち受けていたものは、 花の都・巴里に新設される秘密部隊隊長への任命であった……